Käibemaksugrupi eeliseid ei ole Eestis veel piisavalt kasutatud. Võibolla seepärast, et puudub vajalik teadmine.

Käibemaksugrupi eelis on kindlasti see, kui gruppi kuuluvatel äriühingutel on osaline sisendkäibemaksu mahaarvamine. Siis võib juhtuda, et ühe grupi liikme sisendkäibemaksu mahaarvamise proportsioon võib suureneda grupi teise liikme maksustatava käibe arvelt.

Käibemaksuseaduse (KMS) § 26 lg 7 kohaselt ei loeta käibemaksugruppi kuuluvate isikute omavahelisi tehinguid käibeks. Kui näiteks ühte kontserni kuuluvad tootmise, jaekaubanduse ja transpordi ettevõtted, siis käibemaksugrupi puhul ei ole nende omavahelised tehingud käive. Käibemaksu kohustust ei teki, puudub vajadus käibemaksu maksta ning seda teiselt poolt riigilt tagasi küsida. Samas äriühingud tegutsevad ikkagi juriidiliselt edasi oma nime all. Tehingutes kolmandate isikutega kasutavad nad oma ärinime ja ühist käibemaksu numbrit. 

Käibemaksuseaduse (KMS) alusel registreerib maksuhaldur maksukohustuslaste ühise taotluse alusel ühe maksukohustuslasena (käibemaksugrupina) kui nad on emaettevõtja ja tütarettevõtjad äriseadustiku tähenduses. Samuti registreeritakse majanduslikult ja organisatsiooniliselt seotud maksukohustuslased ühise taotluse alusel käibemaksugrupina, kui iga käibemaksugrupi koosseisus registreeritava äriühingu aktsiatest, osalusest või häältest kuulub samale isikule rohkem kui 50% või kui isikud on seotud frantsiisilepingu alusel. Varemalt oli KMS sõnastuses vähemalt 50%. 

Käibemaksugrupile omistatakse ühine maksukohustuslasena registreerimise number, mida grupi liikmed kasutavad tehingutes grupiväliste isikutega. Samal ajal jätkavad grupi liikmed oma ärinime kasutamist. Grupi liikmete vahelisi tehinguid käibena ei käsitata. Maksuhalduriga suhtlemiseks valitakse esindusisik, kellel on käibedeklaratsiooni esitamise kohustus. Iga grupi liige ei esita maksuhaldurile eraldi käibedeklaratsiooni. Enammakstud käibemaks tagastatakse grupi esindusisikule. Iga maksukohustuslane saab kuuluda ainult ühte käibemaksugruppi.